Сюжет игры Сталкер «Чистое небо» предшествует событиям, которые разворачиваются в первой части, т. е. за год. В данный период в Зону вытекает огромнейшее количество радиоактивных компонентов, а как известно радиация источник для мутации всех живых компонентов, поэтому в игре встречается много отклонений от статистической нормы, аномалий, как внешних так и на организменном уровне. В новой части игры мы станем наблюдателями формирования Зоны, сможем проникать в неизвестные и недоступные ранее территории – Тёмный лес, подземелья Припяти, город Лиманск. Разрабатывается 12 – 15 уровней, проходящих на новых территориях, нам будут доступны и другие ранее изученные локации.
На территории Зоны размещены артефакты, которые притягивают мародёров, желающих получить лёгкую наживу и любителей острых ощущений. Люди создают группировки, среди которых есть лидирующие и просто готовые жить по жёстким правилам Зоны. Главный герой будет уделять основное вниманию выбору группировки и социальным отношением между группами. Желание заработать и испытать что-то новенькое его притянули на зараженную территорию. Игровой сюжет позволяет делать выбор и предоставляет множество возможностей для действий. Он сможет в любой момент выйти из одной группировки и присоединиться к другой.
В сиквеле каждая группировка оборудуется обособленную базу, которая имеет свою микроструктуру, напоминающую небольшой городок со своими развлечениями и лидерами. Группировки существенно отличаются между собой поведением. Присоединившись к группировке, герой поначалу имеет птичьи права и исполняет все поручения авторитетных людей. Для начала он будет получать не сложные поручения, к примеру, принести определённый артефакт. Через время, заработав уважение и доверие товарищей, герой становиться приближённым к лидеру группы. На боевых территориях находятся – чеклоинты - контрольные точки, чем их больше в распоряжении группировки, тем она круче и сильнее.
В новой версии Сталкера появиться возможность выбирать и совершенствовать боевое оружие, чем-то его дополнят. Герой сможет осуществлять выстрелы из обеих рук. Разнообразие оружия и методы его использования, по словам разработчиков будут сильно отличаться от такового в первой части.
Сейчас разработчики заняты созданием искусственного интеллекта, который по прогнозам обещает быть сделан на очень высоком уровне, появиться естественность и он будет живее прежнего. К примеру, герой сможет поговорить, с обычным воякой про ход последних событий. Настроенные враждебно группы умело прячутся в природных укрытиях, использует окружающие предметы, работают командно.
По словам разработчиков, новый проект будет действительно интересным и нестандартным. Нам остаётся только ждать выход игры, чтобы убедиться в отменном качестве игры Stalker: Clear Sky.